MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Repeats of Alteromonas macleodii AltDE1 plasmid pAMDE1-300

Total Repeats: 5724

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
5501	NC_019394	GCTG	2	8	291522	291529	0 %	25 %	50 %	25 %	Non-Coding
5502	NC_019394	TAA	2	6	291558	291563	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
5503	NC_019394	T	7	7	291579	291585	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
5504	NC_019394	ATAG	2	8	291673	291680	50 %	25 %	25 %	0 %	410864036
5505	NC_019394	TCT	2	6	291818	291823	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	410864036
5506	NC_019394	TTC	2	6	291854	291859	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	410864036
5507	NC_019394	GAA	2	6	291894	291899	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	410864036
5508	NC_019394	TTA	2	6	291929	291934	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	410864036
5509	NC_019394	ACTA	2	8	292006	292013	50 %	25 %	0 %	25 %	410864036
5510	NC_019394	AAT	2	6	292024	292029	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	410864036
5511	NC_019394	CCCTCC	2	12	292135	292146	0 %	16.67 %	0 %	83.33 %	410864036
5512	NC_019394	ATG	2	6	292165	292170	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
5513	NC_019394	AGA	2	6	292310	292315	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
5514	NC_019394	ATT	2	6	292385	292390	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
5515	NC_019394	ATT	2	6	292420	292425	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
5516	NC_019394	T	7	7	292424	292430	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
5517	NC_019394	ATA	2	6	292504	292509	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	410864037
5518	NC_019394	TTC	2	6	292560	292565	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	410864037
5519	NC_019394	CTGC	2	8	292581	292588	0 %	25 %	25 %	50 %	410864037
5520	NC_019394	AAGA	2	8	292600	292607	75 %	0 %	25 %	0 %	410864037
5521	NC_019394	A	6	6	292617	292622	100 %	0 %	0 %	0 %	410864037
5522	NC_019394	A	6	6	292701	292706	100 %	0 %	0 %	0 %	410864038
5523	NC_019394	TACC	2	8	292793	292800	25 %	25 %	0 %	50 %	410864038
5524	NC_019394	T	6	6	292818	292823	0 %	100 %	0 %	0 %	410864038
5525	NC_019394	T	6	6	292887	292892	0 %	100 %	0 %	0 %	410864038
5526	NC_019394	AGG	2	6	293072	293077	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	410864038
5527	NC_019394	ATCT	2	8	293093	293100	25 %	50 %	0 %	25 %	410864038
5528	NC_019394	A	7	7	293177	293183	100 %	0 %	0 %	0 %	410864038
5529	NC_019394	CTA	2	6	293207	293212	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	410864038
5530	NC_019394	ATA	2	6	293220	293225	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	410864038
5531	NC_019394	TTA	2	6	293304	293309	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	410864039
5532	NC_019394	GT	4	8	293357	293364	0 %	50 %	50 %	0 %	410864039
5533	NC_019394	CCAA	2	8	293365	293372	50 %	0 %	0 %	50 %	410864039
5534	NC_019394	TCT	2	6	293413	293418	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	410864039
5535	NC_019394	CTT	2	6	293466	293471	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	410864039
5536	NC_019394	ATTC	2	8	293524	293531	25 %	50 %	0 %	25 %	410864039
5537	NC_019394	TAC	2	6	293581	293586	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
5538	NC_019394	AATG	2	8	293609	293616	50 %	25 %	25 %	0 %	Non-Coding
5539	NC_019394	TTC	2	6	293668	293673	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
5540	NC_019394	AGA	2	6	293753	293758	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
5541	NC_019394	ATT	2	6	293823	293828	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
5542	NC_019394	TAA	2	6	293835	293840	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
5543	NC_019394	CATA	2	8	293913	293920	50 %	25 %	0 %	25 %	Non-Coding
5544	NC_019394	AT	3	6	293950	293955	50 %	50 %	0 %	0 %	410864040
5545	NC_019394	T	6	6	293998	294003	0 %	100 %	0 %	0 %	410864040
5546	NC_019394	TACA	2	8	294014	294021	50 %	25 %	0 %	25 %	410864040
5547	NC_019394	TCA	2	6	294094	294099	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	410864040
5548	NC_019394	AGT	2	6	294112	294117	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	410864040
5549	NC_019394	T	6	6	294128	294133	0 %	100 %	0 %	0 %	410864040
5550	NC_019394	TCT	2	6	294165	294170	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	410864040
5551	NC_019394	CTA	2	6	294187	294192	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	410864040
5552	NC_019394	T	9	9	294274	294282	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
5553	NC_019394	T	6	6	294333	294338	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
5554	NC_019394	ATT	2	6	294345	294350	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
5555	NC_019394	GTAT	2	8	294408	294415	25 %	50 %	25 %	0 %	Non-Coding
5556	NC_019394	TA	3	6	294558	294563	50 %	50 %	0 %	0 %	410864041
5557	NC_019394	AAC	3	9	294582	294590	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	410864041
5558	NC_019394	CAA	2	6	294763	294768	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	410864042
5559	NC_019394	TAA	2	6	294774	294779	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	410864042
5560	NC_019394	CAC	2	6	294787	294792	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	410864042
5561	NC_019394	T	6	6	294864	294869	0 %	100 %	0 %	0 %	410864042
5562	NC_019394	TAT	2	6	295015	295020	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	410864042
5563	NC_019394	ATG	2	6	295065	295070	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	410864042
5564	NC_019394	AAT	2	6	295123	295128	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	410864042
5565	NC_019394	TAT	2	6	295227	295232	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	410864042
5566	NC_019394	TAT	2	6	295463	295468	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	410864042
5567	NC_019394	CAA	2	6	295477	295482	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	410864042
5568	NC_019394	TTAACA	2	12	295551	295562	50 %	33.33 %	0 %	16.67 %	410864042
5569	NC_019394	ACAA	2	8	295584	295591	75 %	0 %	0 %	25 %	410864042
5570	NC_019394	AAC	2	6	295613	295618	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	410864042
5571	NC_019394	TTAA	2	8	295619	295626	50 %	50 %	0 %	0 %	410864042
5572	NC_019394	AAT	2	6	295629	295634	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	410864042
5573	NC_019394	CTT	2	6	295650	295655	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
5574	NC_019394	T	6	6	295780	295785	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
5575	NC_019394	TAC	2	6	295851	295856	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
5576	NC_019394	ACC	2	6	295896	295901	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
5577	NC_019394	TATTTT	2	12	295911	295922	16.67 %	83.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
5578	NC_019394	T	7	7	295919	295925	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
5579	NC_019394	T	8	8	295929	295936	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
5580	NC_019394	ATT	2	6	295951	295956	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
5581	NC_019394	TTTA	4	16	295957	295972	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding
5582	NC_019394	A	8	8	296019	296026	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
5583	NC_019394	TCG	2	6	296079	296084	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	410864043
5584	NC_019394	T	6	6	296104	296109	0 %	100 %	0 %	0 %	410864043
5585	NC_019394	CTT	2	6	296137	296142	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	410864043
5586	NC_019394	TTC	2	6	296188	296193	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	410864043
5587	NC_019394	ATT	2	6	296237	296242	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	410864043
5588	NC_019394	T	6	6	296309	296314	0 %	100 %	0 %	0 %	410864043
5589	NC_019394	AACA	2	8	296380	296387	75 %	0 %	0 %	25 %	410864043
5590	NC_019394	T	6	6	296394	296399	0 %	100 %	0 %	0 %	410864043
5591	NC_019394	GCC	2	6	296575	296580	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	410864043
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5593	NC_019394	T	6	6	296630	296635	0 %	100 %	0 %	0 %	410864043
5594	NC_019394	CCA	2	6	296708	296713	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	410864043
5595	NC_019394	TAT	2	6	296754	296759	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	410864043
5596	NC_019394	TCT	2	6	296906	296911	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	410864043
5597	NC_019394	TAA	2	6	296917	296922	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	410864043
5598	NC_019394	CGA	2	6	296934	296939	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	410864043
5599	NC_019394	TTA	2	6	296942	296947	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	410864043
5600	NC_019394	TAG	2	6	296970	296975	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	410864043
5601	NC_019394	AGC	2	6	297055	297060	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	410864043
5602	NC_019394	CAT	2	6	297075	297080	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	410864043
5603	NC_019394	TA	3	6	297094	297099	50 %	50 %	0 %	0 %	410864043
5604	NC_019394	CTT	2	6	297123	297128	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	410864043
5605	NC_019394	CGCT	2	8	297144	297151	0 %	25 %	25 %	50 %	410864043
5606	NC_019394	ATTTTC	2	12	297160	297171	16.67 %	66.67 %	0 %	16.67 %	410864043
5607	NC_019394	CTA	2	6	297211	297216	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
5608	NC_019394	T	7	7	297224	297230	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
5609	NC_019394	T	7	7	297232	297238	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
5610	NC_019394	ATT	2	6	297262	297267	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
5611	NC_019394	CTT	2	6	297312	297317	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	410864044
5612	NC_019394	CAA	2	6	297353	297358	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	410864044
5613	NC_019394	T	6	6	297405	297410	0 %	100 %	0 %	0 %	410864044
5614	NC_019394	AAG	2	6	297417	297422	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	410864044
5615	NC_019394	CAT	2	6	297430	297435	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	410864044
5616	NC_019394	TAC	3	9	297445	297453	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	410864044
5617	NC_019394	GAG	2	6	297467	297472	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	410864044
5618	NC_019394	C	6	6	297488	297493	0 %	0 %	0 %	100 %	410864044
5619	NC_019394	AGA	2	6	297515	297520	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	410864044
5620	NC_019394	ACT	2	6	297617	297622	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	410864044
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5622	NC_019394	GCT	2	6	297686	297691	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	410864044
5623	NC_019394	CAAG	2	8	297731	297738	50 %	0 %	25 %	25 %	410864044
5624	NC_019394	TAC	2	6	297739	297744	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	410864044
5625	NC_019394	CAT	2	6	297757	297762	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	410864044
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©2012. Centre for DNA Fingerprinting & Diagnostics (CDFD), Hyderabad.